Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brinp3Q499E0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brinp3Q499E0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brinp3Q499E0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Brinp3Q499E0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brinp3Q499E0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brinp3Q499E0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brinp3Q499E0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brinp3Q499E0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brinp3Q499E0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brinp3Q499E0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brinp3Q499E0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brinp3Q499E0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brinp3Q499E0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brinp3Q499E0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brinp3Q499E0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brinp3Q499E0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brinp3Q499E0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Brinp3Q499E0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brinp3Q499E0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brinp3Q499E0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Brinp3Q499E0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Brinp3Q499E0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brinp3Q499E0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brinp3Q499E0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brinp3Q499E0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brinp3Q499E0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brinp3Q499E0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brinp3Q499E0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms