Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms