Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms