Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Ccdc185Q3V118 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Ccdc185Q3V118 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Ccdc185Q3V118 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Ccdc185Q3V118 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Ccdc185Q3V118 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Ccdc185Q3V118 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc185Q3V118 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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