Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms