Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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Usp48Q3V0C5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp48Q3V0C5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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Usp48Q3V0C5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp48Q3V0C5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp48Q3V0C5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Usp48Q3V0C5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
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Usp48Q3V0C5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp48Q3V0C5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp48Q3V0C5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp48Q3V0C5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp48Q3V0C5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Usp48Q3V0C5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Usp48Q3V0C5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Usp48Q3V0C5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp48Q3V0C5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp48Q3V0C5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Usp48Q3V0C5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp48Q3V0C5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Usp48Q3V0C5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp48Q3V0C5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp48Q3V0C5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp48Q3V0C5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Usp48Q3V0C5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Usp48Q3V0C5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp48Q3V0C5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp48Q3V0C5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp48Q3V0C5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp48Q3V0C5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp48Q3V0C5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp48Q3V0C5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp48Q3V0C5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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Usp48Q3V0C5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp48Q3V0C5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp48Q3V0C5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp48Q3V0C5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp48Q3V0C5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp48Q3V0C5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp48Q3V0C5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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