Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttc9Q3V038 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc9Q3V038 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms