Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms