Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rnpc3Q3UZ01 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnpc3Q3UZ01 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms