Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pfdn4Q3UWL8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn4Q3UWL8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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