Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW22

Defb48, Beta-defensin 42, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb48Q3UW22 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defb48Q3UW22 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms