Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clpsl2Q3UW21 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms