Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chpf2Q3UU43 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chpf2Q3UU43 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chpf2Q3UU43 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chpf2Q3UU43 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms