Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acsf3Q3URE1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acsf3Q3URE1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acsf3Q3URE1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acsf3Q3URE1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acsf3Q3URE1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Acsf3Q3URE1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acsf3Q3URE1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acsf3Q3URE1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acsf3Q3URE1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acsf3Q3URE1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Acsf3Q3URE1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acsf3Q3URE1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acsf3Q3URE1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acsf3Q3URE1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acsf3Q3URE1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acsf3Q3URE1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acsf3Q3URE1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acsf3Q3URE1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acsf3Q3URE1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acsf3Q3URE1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acsf3Q3URE1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acsf3Q3URE1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms