Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms