Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFK8

Frmd8, FERM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd8Q3UFK8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Frmd8Q3UFK8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmd8Q3UFK8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms