Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Puf60Q3UEB3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Puf60Q3UEB3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms