Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VwceQ3U515 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms