Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms