Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
InipQ3TXT3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
InipQ3TXT3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
InipQ3TXT3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
InipQ3TXT3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
InipQ3TXT3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
InipQ3TXT3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
InipQ3TXT3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
InipQ3TXT3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
InipQ3TXT3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
InipQ3TXT3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
InipQ3TXT3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
InipQ3TXT3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
InipQ3TXT3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
InipQ3TXT3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
InipQ3TXT3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
InipQ3TXT3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
InipQ3TXT3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
InipQ3TXT3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
InipQ3TXT3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
InipQ3TXT3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
InipQ3TXT3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
InipQ3TXT3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
InipQ3TXT3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
InipQ3TXT3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
InipQ3TXT3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
InipQ3TXT3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
InipQ3TXT3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
InipQ3TXT3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
InipQ3TXT3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
InipQ3TXT3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
InipQ3TXT3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
InipQ3TXT3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms