Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21440Q3TTD8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms