Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSG4

Alkbh5, RNA demethylase ALKBH5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh5Q3TSG4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms