Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctdnep1Q3TP92 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctdnep1Q3TP92 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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