Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc10Q3TLI0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms