Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms