Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc69Q3TCJ8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms