Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrp1aQ2LKU9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms