Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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ptchd1Q14B62 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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ptchd1Q14B62 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
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