Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms