Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q08AU9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q08AU9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q08AU9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q08AU9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q08AU9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q08AU9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q08AU9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q08AU9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q08AU9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q08AU9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q08AU9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q08AU9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q08AU9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q08AU9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q08AU9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q08AU9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q08AU9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q08AU9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q08AU9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q08AU9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q08AU9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q08AU9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q08AU9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q08AU9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q08AU9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q08AU9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q08AU9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q08AU9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q08AU9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Q08AU9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q08AU9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q08AU9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q08AU9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q08AU9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Q08AU9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q08AU9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q08AU9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q08AU9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q08AU9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q08AU9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q08AU9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q08AU9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q08AU9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q08AU9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Q08AU9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q08AU9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q08AU9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q08AU9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q08AU9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q08AU9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q08AU9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q08AU9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q08AU9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q08AU9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q08AU9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q08AU9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q08AU9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q08AU9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q08AU9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q08AU9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q08AU9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q08AU9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q08AU9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q08AU9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q08AU9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q08AU9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms