Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CbfbQ08024 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms