Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf9Q07105 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf9Q07105 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms