Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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