Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnd1Q03719 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms