Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tff2Q03404 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms