Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms