Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms