Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms