Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms