Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms