Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GabpaQ00422 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms