Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smn1P97801 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smn1P97801 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smn1P97801 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smn1P97801 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms