Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Meis3P97368 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Meis3P97368 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Meis3P97368 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Meis3P97368 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Meis3P97368 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Meis3P97368 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Meis3P97368 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Meis3P97368 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms