Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RptnP97347 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RptnP97347 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RptnP97347 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RptnP97347 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RptnP97347 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RptnP97347 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RptnP97347 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RptnP97347 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RptnP97347 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RptnP97347 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RptnP97347 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RptnP97347 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RptnP97347 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RptnP97347 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RptnP97347 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RptnP97347 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RptnP97347 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RptnP97347 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RptnP97347 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RptnP97347 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RptnP97347 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RptnP97347 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RptnP97347 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RptnP97347 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RptnP97347 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RptnP97347 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RptnP97347 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RptnP97347 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RptnP97347 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RptnP97347 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RptnP97347 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RptnP97347 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RptnP97347 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RptnP97347 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RptnP97347 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RptnP97347 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RptnP97347 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RptnP97347 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RptnP97347 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RptnP97347 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RptnP97347 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RptnP97347 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RptnP97347 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RptnP97347 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RptnP97347 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RptnP97347 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RptnP97347 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RptnP97347 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RptnP97347 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RptnP97347 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RptnP97347 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RptnP97347 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RptnP97347 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RptnP97347 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RptnP97347 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RptnP97347 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RptnP97347 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RptnP97347 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RptnP97347 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RptnP97347 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RptnP97347 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RptnP97347 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RptnP97347 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RptnP97347 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RptnP97347 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RptnP97347 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RptnP97347 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RptnP97347 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RptnP97347 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RptnP97347 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RptnP97347 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RptnP97347 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RptnP97347 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RptnP97347 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RptnP97347 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RptnP97347 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RptnP97347 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RptnP97347 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RptnP97347 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RptnP97347 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RptnP97347 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RptnP97347 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RptnP97347 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RptnP97347 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RptnP97347 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RptnP97347 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RptnP97347 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RptnP97347 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RptnP97347 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RptnP97347 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RptnP97347 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RptnP97347 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RptnP97347 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RptnP97347 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RptnP97347 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RptnP97347 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RptnP97347 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RptnP97347 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RptnP97347 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms