Protein–RNA interactions for Protein: P70408

Cdh10, Cadherin-10, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh10P70408 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh10P70408 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh10P70408 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh10P70408 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh10P70408 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh10P70408 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh10P70408 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh10P70408 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh10P70408 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh10P70408 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh10P70408 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh10P70408 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh10P70408 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh10P70408 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh10P70408 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh10P70408 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh10P70408 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh10P70408 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh10P70408 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh10P70408 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh10P70408 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh10P70408 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms