Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms