Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfi1P70338 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms