Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb13P70321 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb13P70321 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms