Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms