Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chl1P70232 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chl1P70232 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chl1P70232 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chl1P70232 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chl1P70232 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chl1P70232 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chl1P70232 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chl1P70232 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms